病毒和其他引起疾病的微生物会影响其宿主针对它们的免疫反应类型。在某些情况下，主要反应涉及抗体，即免疫系统产生的蛋白质，可以特异性识别入侵微生物的部分并介导其破坏。在其他情况下，训练免疫细胞识别微生物并引发针对微生物的攻击。

科学家已经广泛研究了导致抗体或细胞介导的反应的机制，大约10年前，有人提出了一种新颖的信号作为细胞介导的反应的触发因素。在当前的研究中，贝勒研究人员William Decker博士，Matthew Halpert博士，Vanaja Konduri博士及其同事提供了支持该现象的综合证据，并提出了其作用机理。

经典的免疫反应

研究表明，与微生物有关的两个因素会显着影响将占主导地位的免疫反应的类型。一方面是微生物成分(蛋白质或遗传物质的一部分，称为病原体相关分子模式或PAMP)，另一方面是微生物的位置，无论它们倾向于位于细胞内部还是细胞外部。细胞具有识别PAMP的手段吗?一些细胞蛋白识别细胞内的PAMP，而另一些则检测细胞外的PAMP。

对病毒的研究表明，当在细胞内部检测到病毒遗传物质时，就会产生细胞介导的免疫反应，而在细胞外检测到病毒蛋白会触发抗体介导的反应。

这些免疫应答的实施涉及称为模式识别受体或PRR的细胞蛋白。抗原呈递细胞，例如树突状细胞，参与形成特异性免疫应答的第一步。在这些第一步中，抗原呈递细胞通过将PAMP与其PRR结合来对细胞内和细胞外环境进行采样。通过PRR识别PAMP会打开危险警报，并向免疫系统的其余部分发出异物入侵者警报。

触发细胞介导的免疫反应的新机制

除了这些经过研究的介导经典免疫应答的信号外，Baylor研究人员还提出并证明了一种将免疫应答引导至细胞类型的不同机制。这种新机制还涉及对细胞内和细胞外环境的监视，但是需要通过另一类称为主要组织相容性复合体(MHC)的蛋白质进行监视。I类MHC结合细胞内发现的蛋白质片段，而II类MHC结合细胞外存在的蛋白质片段。

病理学和免疫学副教授，这项工作的相应作者德克尔说：“这种机制似乎主要是在暴发性病毒感染发生时发生的。”

当病毒大量繁殖时，可以在细胞内外发现大量的病毒蛋白。这种情况的一个可能结果是，相同的蛋白质片段与抗原呈递细胞上的MHC I类和II类蛋白结合。

德克尔(Bayker的丹·邓肯综合癌症中心(Dan L Duncan综合癌症中心)的成员)说，当这种情况与其他炎症线索一起发生时，“会触发反应，从而增强针对该病毒的细胞介导的免疫力。”“在这种情况下，反应并不取决于任何特定的PAMP结构。而是取决于这样的事实，即，由I类和II类MHC结合的病毒片段具有相同的氨基酸序列。”