生物科学门户网站
BIO1000.COM

探索癌症的蛋白质组学领域以发现药物靶标

贝勒医学院的研究人员表明,对侵略性人类癌症进行蛋白质组学或所有蛋白质数据的分析是识别潜在的新型治疗靶标的有用方法。他们在《癌基因》(Oncogene)杂志上报告了“蛋白质组学特征”的鉴定,这些特征与所研究的7种癌症类型的侵略性疾病的临床指标有关。一些特征在不同类型的癌症之间共享,包括新陈代谢改变的细胞途径。重要的是,实验结果提供了概念证明,即其蛋白质组学分析方法是识别潜在治疗靶点的宝贵策略。

共同通讯的作者,医学教授兼医学博士Chad Creighton博士说:“这项研究有两个值得注意的方面。一个是我们探索了癌症的蛋白质组学前景,以寻找与侵略性癌症相关的表达蛋白。”贝勒(Dan L Duncan)综合癌症中心癌症生物信息学主任。“我们分析了蛋白质数据,其中包括来自大约800种肿瘤的成千上万种蛋白质,其中包括7种不同类型的癌症-乳腺癌,结肠癌,肺癌,肾癌,卵巢癌,子宫癌和小儿神经胶质瘤-可通过临床蛋白质组学肿瘤分析联合会(CPTAC)获得基于光谱的蛋白质组学数据集。”

对CPTAC数据集的计算分析确定了与侵略性癌症相关的蛋白质组学特征。这些特征指向改变的细胞途径,这些途径可能驱动侵略性癌症行为,并可能代表新的治疗靶标。每种癌症类型均以其侵袭性形式表现出独特的蛋白质组学特征。有趣的是,一些特征对于不同类型的癌症是共有的。

这项研究的另一个方面是提供概念证明,即蛋白质组学分析是确定可能被操纵以控制癌症生长的侵袭性疾病驱动程序的有用策略。

贝勒大学病理学和免疫学助理教授戴安娜·蒙西瓦伊斯(Diana Monsivais)博士说:“这正是我们使用这个功能强大的新数据集所能做到的。”“我们专注于子宫癌数据,通过计算分析可以确定与侵袭性癌症有关的多种蛋白质的变化。我们选择了蛋白激酶,这些酶代表了更强的治疗候选药物。”

研究人员从数百种初始候选药物中选择了四种激酶用于子宫癌细胞系的功能研究。他们发现,这些激酶不仅在子宫癌细胞系中表达,而且操纵某些激酶的表达会降低某些子宫癌细胞的存活率或迁移能力。细胞迁移是癌细胞的一种特性,可让它们将癌症传播到其他组织。

这项工作是两个Baylor中心,Dan L Duncan综合癌症中心和药物发现中心之间富有成效的合作的结果。

Monsivais说:“ Chad对新的CPTAC数据集进行了精彩的分析,并有兴趣在人类癌症中进行验证。他向我们提供了进行功能研究的方法,以确定某些蛋白质是否可以转化为子宫内膜癌的新靶标,” Monsivais说。“我们的实验提供了概念证明,蛋白质组学分析是一种有用的策略,不仅可以更好地了解癌症的驱动因素,而且可以找到控制或消除癌症的新方法。”

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如作者信息标记有误,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。