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米兰理工大学的一项研究揭示了DNA的语法

2020年8月27日,米兰-DNA三维结构由一系列基于特定蛋白质序列及其顺序的空间规则所决定。这是米兰理工大学计算机科学与工程学博士生Luca Nanni与同一大学的Stefano Ceri教授和奈梅亨大学的Colin Logie教授最近发表在基因组生物学上的一项研究的发现。

该研究的第一作者Luca Nanni说:“我们的研究的最大创新在于为CTCF蛋白的定位确定了精确的规则。CTCF语法的优美和简单性向我们展示了自然和进化如何产生规律性以及令人难以置信的巧妙而功能强大的系统。 ”“了解了这些规则后,就可以对CTCF序列进行改造,以获得所需的DNA三维结构。例如,应该有可能使两个相互断开的基因相互作用。塑造DNA结构将为创造用于治疗疾病的药物打开大门例如癌症。”

如果完全展开,DNA分子将长约两米,它基于一个复杂的系统来包裹自身,该系统维持其可访问性并正确读取以驻留在细胞核中。研究基因组三维结构的关键是拓扑结构域,它们被认为聚集了具有相似作用和行为的DNA区域。例如,具有类似功能的基因可能位于相同的拓扑结构域中。Nanni继续说道:“我们专注于一些编码CTCF蛋白的特定DNA序列。”“这种蛋白质可分离出DNA的各个部分,从而在各种拓扑结构域之间形成障碍。借助计算机模拟以及创建根据这些蛋白质的方向对这些蛋白质进行分类的模型,

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