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新物质库可加快对活性化合物的搜索

为了使药物有效,它们通常必须停靠在生物体内的蛋白质上。就像锁中的钥匙一样,部分药物分子必须适合目标蛋白质的凹处或空腔。多年来,由曼弗雷德·魏斯(Manfred Weiss)博士领导的HZB高分子晶体学系(MX)团队与马尔堡大学(Gerhard Klebe)教授领导的药物设计小组一起致力于建立已知的作为片段库。这些由小的有机分子(片段)组成,可以探测并绘制蛋白质表面上功能上重要的空腔。蛋白质晶体中充满了片段,然后使用强大的X射线分析。这允许在原子分辨率级别获得三维结构信息。除其他事项外,有可能发现特定分子片段与靶蛋白的对接程度。这些物质库的开发是Frag4Lead联合研究项目的一部分,由德国联邦教育与研究部(BMBF)资助。

MX团队(MX代表大分子晶体学)现在已经发布了一种化学多样性的片段库的设计,该片段库称为“ F2X-Universal”库,其中包含1,103种化合物。从该库中提取了96种化合物的代表性选择,这被称为F2X Entry Screen。在发布库的过程中,HZB的MX团队现已在瑞典隆德的MAX IV X射线源和BESSY II上成功测试和验证了此选择。

在这项研究中,HZB和MAX IV团队通过筛选内皮抑素和Aar2 / RnaseH蛋白复合物作为目标酶,验证了F2X Entry库的效率。下一步,MX团队将使用整个通用库。

HZB MX小组的UweMüller博士说:“对于当前的研究,HZB-BESSY II的片段筛选专家与MAX IV的FragMAX项目团队密切合作。”他帮助在BESSY建立了三条MX光束线II以及MAX IV的BioMAX光束线。“这使双方能够进一步开发自己的技术平台,并将其用于成像不同蛋白质的功能表面。这将是MAX IV和HZB未来合作的良好基础。”

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