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第一份全球土壤细菌图谱

什么生活在你的污垢?CU Boulder研究人员在编制了第一份全球土壤细菌群落地图集并确定了一组约500种全球常见且丰富的关键物种后,距离发现还有一步之遥。

这项新研究发表在今天的“科学”杂志上,将土壤栖息细菌的巨大多样性缩小到“最想要的”名单,该名单将指导未来研究和操纵影响养分循环,土壤肥力等的微生物。重要的生态功能。

“通过这项研究,我们已经开始打开黑匣子,并且正在更好地了解微生物在我们的土壤中的生活,”该研究的第一作者,合作研究所的博士后研究员Manuel Delgado-Baquerizo说。在CU Boulder的环境科学(CIRES)。

土壤细菌占地球生物生物量的很大一部分,并促进关键的土壤过程,如碳循环和养分供应。但是,尽管经过数十年的研究,生活在土壤中的微生物 - 甚至是来自普通北美后院的土壤 - 仍然知之甚少,因为物种数量达到数万种。大多数物种仍未被描述 - 它们与现有的基因组记录不匹配,并且未在实验室中成功培养。

“令人惊讶的是,即使是在土壤中发现的最主要的微生物,我们仍然不知道多少,”CIRES研究员,新研究的合着者诺亚菲耶尔说。“他们中的许多人甚至没有名字。”

为了进行这项研究,研究人员从六大洲和18个国家的237个不同地点收集了土壤样本,涵盖了从沙漠到草原到湿地的整个气候。然后,他们使用DNA测序来识别每个位点发现的细菌类型,并确定哪些物种在不同类型的土壤中共享。

研究人员发现,只有2%的细菌分类群 - 或大约500种个体 - 一直占全球土壤细菌群落的近一半。

已被确定为显性和普遍存在,这些可预测的常见细菌现在可以作为未来研究的目标。

“现在我们有了这个清单,我们可以把我们的研究重点放在对这些主要群体进行分类,看看他们在哪里以及他们做了什么,”Fierer说,他也是CU Boulder生态和进化生物学系的副教授( EBIO)。

对土壤细菌的特性和功能的持续研究可能会在未来导致农业应用。

“最终,了解更多这些细菌可能会让我们改善土壤健康和生育能力,”Delgado-Baquerizo说道,他与西班牙马德里的Rey Juan Carlos大学有着双重关系。“我们现在可以做很多事情,因为我们有一些易处理的信息。”

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