呋喃妥因是一种常用的抗生素，主要用于治疗泌尿系统感染。尽管它在治疗这类感染方面非常有效，但其抗菌谱并不包括所有的细菌种类。例如，呋喃妥因对革兰氏阳性菌的效果较差，尤其是金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）和肺炎链球菌（Streptococcus pneumoniae）。相反，它对大肠杆菌（Escherichia coli）、变形杆菌（Proteus mirabilis）和克雷伯氏菌（Klebsiella pneumoniae）等革兰氏阴性菌具有较好的抗菌活性。

此外，呋喃妥因也不适用于治疗由厌氧菌引起的感染，如脆弱拟杆菌（Bacteroides fragilis）。因此，在临床应用中，医生会根据患者的具体情况和病原体类型选择合适的药物。对于某些特定的细菌感染，可能需要联合使用其他类型的抗生素以确保疗效。